Polis, başlatılan soruşturmada kayıp kişi Ahmet Şahin’in sık görüştüğü baldızının eşi Muzaffer A.’nın ifadesine başvurdu. Muzaffer A., Ahmet Şahin’i en son para verdiği gün gördüğünü ve uzun süredir görüşmediklerini söyledi. Şüpheli, ifadesinin ardından serbest bırakıldı.
Kayıp Şahıslar Büro Amirliği, olayla ilgili soruşturmayı derinleştirdi ve Ahmet Şahin’in cep telefonu görüşmelerini inceledi. İncelemeler, 24 Ocak Cumartesi günü Ahmet Şahin’in sık sık Muzaffer A. ile görüştüğünü ortaya çıkardı. Güvenlik kamerası kayıtları incelendiğinde, Şahin ve Muzaffer A.’nın sabah saat 09.00’da Arnavutköy’e birlikte gittiği, saat 13.42’de ise Muzaffer A.’nın tek başına bölgeden ayrıldığı belirlendi.
Polis, güvenlik kameraları ve HTS kayıtlarını inceleyerek olayın Yeniköy Mezarlığı civarında gerçekleştiğini tespit etti. Yapılan aramalarda, Ahmet Şahin’in cesedi mezarlık karşısındaki ormanlık alanda bulundu. Cesedin ağaçlık alana atıldığı ve dallarla örtülerek gizlenmeye çalışıldığı belirlendi. Vahşi hayvanlar tarafından bir kısmı tahrip edilen ceset Adli Tıp Kurumu Morgu’na kaldırıldı. DNA testleri, cesedin Ahmet Şahin’e ait olduğunu belirledi. Ayrıca, Şahin’in vücuduna isabet eden 5 kurşun sonucu hayatını kaybettiği tespit edildi.
Polis, Muzaffer A.’yı yakalamak için harekete geçti. Cep telefonunu kapatan şüpheliye ulaşmak amacıyla annesi F. Ş. takibe alındı. Anne F. Ş., iftar saatinde bir parka gidip beklemeye başladı. Bir süre sonra yanına gelen Muzaffer A., parkta gözaltına alındı. Polis, şüphelinin annesinden yeni elbiseler almak için parka gittiğini belirledi.