Mustafa Çiftçi, 1970 yılında Konya’nın Çumra ilçesinde dünyaya geldi. Eğitim hayatındaki başarısını, Türkiye’nin en köklü bürokrat yetiştirme kurumu olan Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi (Mülkiye) Kamu Yönetimi bölümünden mezun olarak taçlandırdı.
Kamu görevine 1996 yılında İçişleri Bakanlığı Kaymakam Adayı olarak adım atan Çiftçi, Türkiye’nin dört bir yanında kaymakamlık ve ardından valilik yaparak devletin taşra teşkilatını tecrübe etti.
Mustafa Çiftçi’nin biyografisinde en dikkat çeken detaylardan biri Kur’an-ı Kerim hafızı olarak tanınmakta.
Kamuoyunda “Mülkiye” olarak bilinen Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi Kamu Yönetimi bölümü mezunudur.
Bakan olmadan önce Türkiye’nin önemli illerinde Valilik görevini yürütmüş, öncesinde ise İçişleri Bakanlığı merkez teşkilatında üst düzey bürokrat olarak çalışmıştır.