Çardakçı’nın görev yaptığı yerler arasında Giresun Jandarma Bölge Komutanlığı’nda harekât ve asayiş şube müdürlüğü, Jandarma Genel Komutanlığı Genel Plan ve Prensipler Başkanlığı’nda proje subayı ve şube müdürlüğü, Şırnak 23’üncü Jandarma Sınır Tümen Komutanlığı’nda harekât ve asayiş şube müdürlüğü, Kastamonu Jandarma Bölge Komutanlığı’nda kurmay başkanlığı, Şenoba Taktik Jandarma Sınır Alay Komutanlığı, Beytüşşebap Taktik Jandarma Komando Alay Komutanlığı ve Denizli İl Jandarma Komutanlığı yer almıştır. 2010 yılında tuğgeneralliğe terfi etmiştir.
Tuğgeneral rütbesiyle; Zonguldak 3’üncü Jandarma Eğitim Tugay Komutanlığı (2010-2011) ve Kastamonu Jandarma Bölge Komutanlığı (2011-2014) görevlerinde bulunmuştur. 2014 yılında tümgeneralliğe terfi etmiştir ve Tunceli Jandarma Bölge Komutanlığı (2014-2016) ile Jandarma Genel Komutanlığı Asayiş Başkanlığı (2016-2017) görevlerinde bulunmuştur. 2017 yılında korgeneralliğe terfi etmiştir.
Korgeneral rütbesiyle; 2017 yılında İçişleri Bakanlığının 2017/286 Karar sayısı ile Jandarma Genel Komutan Yardımcısı olarak atanmıştır. 2021 yılında Orgeneralliğe terfi eden Ali Çardakçı, Jandarma Genel Komutan Yardımcısı olarak görev yapmış, son olarak Jandarma Genel Komutanı olarak atanmıştır.