İşletmeciler, sefer programlarında yapılacak değişiklikleri en az 1 hafta öncesinden “Düzenli Seferler Bilgi Sistemi” (DSBS) üzerinden idareye bildirmekle yükümlü olacak. Ayrıca, yoğunluk yaşanan özel günlerde ek seferler düzenlenebilecek. Bu ek seferler, kıyı tesislerinin işleyişini aksatmamak ve diğer işletmecilerin seferlerini etkilememek kaydıyla yapılabilecek.
Kiralık olarak işletilen bir gemi satın alındığında, mevcut hat izni belgesi süresi doluncaya kadar geçerli olacak. Düzenli sefer yapan tüm gemiler, Bakanlıkça ilan edilen kulüp veya sigorta kuruluşlarından zorunlu mali sorumluluk sigortası yaptırmakla yükümlü olacak.
Başka bir işletmeciye ait hatta hizmet alımı yöntemiyle çalıştırılacak gemiler için ise ilave hat izni alınması gerekecek.
Kıyı tesislerinde araç ve yolcular için alınan ayakbastı ve benzeri ücretlerin Türk lirası üzerinden belirlenmesi zorunlu hale getirildi. Ayrıca bu ücretlerde tavan tutar, Ulaştırma ve Altyapı Bakanlığı tarafından belirlenecek. Amaç; hizmet kalitesini artırırken serbest ve sürdürülebilir rekabeti sağlamak.
Türkiye ile Kuzey Kıbrıs Türk Cumhuriyeti (KKTC) arasında yapılan deniz taşımacılığı faaliyetlerinde, Bakanlık gerekli gördüğü takdirde alternatif uygulamalar devreye alabilecek.
Türk bayraklı gemiler için önsörvey, yabancı bayraklı gemiler için ise liman devleti denetimi zorunlu olacak. Gemilere uygunluk yazısı verilebilmesi için, geminin bulunduğu mutabakat muhtıralarında kara listede yer almaması ve sertifikalarının güvenilir kuruluşlarca verilmiş olması gerekecek. Aksi halde hat izni verilmeyecek.